【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 带源码课件 学习资源 [73.7G]（PNG）
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<p><img src="https://linux.do/uploads/default/original/4X/e/9/c/e9c2a02d6fdd2609b05d686c614883cfe8bd2504.png" alt="【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 带源码课件" /></p>
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<p>【基础信息】<br />- **资源名称**：【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 带源码课件<br />- **资源大小**：73.7G<br />- **文件数量**：312<br />- **适用人群**：自学/提升/教学参考</p>
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<p>【内容简介】<br />总计: 60 个文件夹, 252 个文件</p>
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<p>【目录清单】</p>
<pre>├──01生物信息入门<br />│ └──01生物信息入门.mp4<br />├──02Linux基础<br />│ ├──02Linux介绍.mp4<br />│ ├──03Linux基础.mp4<br />│ ├──04目录结构.mp4<br />│ ├──05文件操作1.mp4<br />│ ├──06文件操作2.mp4<br />│ ├──07编辑脚本.mp4<br />│ └──08权限和任务管理.mp4<br />├──03生物软件及数据库<br />│ ├──09生物软件简介.mp4<br />│ ├──10安装已编译软件.mp4<br />│ ├──11源代码编译.mp4<br />│ ├──12环境配置.mp4<br />│ ├──13bioconda.mp4<br />│ ├──14腾讯云安装软件.mp4<br />│ ├──15虚拟环境.mp4<br />│ └──16生物数据库管理.mp4<br />├──04illumina测序原理及数据处理<br />│ ├──17测序数据下载.mp4<br />│ ├──18了解测序这件事.mp4<br />│ ├──19illumina测序原理之建库.mp4<br />│ ├──20illumina测序原理之测序.mp4<br />│ ├──21fastq文件介绍.mp4<br />│ ├──22fastq文件处理.mp4<br />│ └──23数据质控和过滤.mp4<br />├──05pacbio测序原理及数据处理<br />│ ├──24pacbio测序原理.mp4<br />│ └──25pacbio数据处理.mp4<br />├──06nanopore测序原理及数据处理<br />│ ├──26nanopore测序原理.mp4<br />│ ├──27碱基识别.mp4<br />│ └──28nanopore数据处理.mp4<br />├──07解决软件报错<br />│ └──29解决软件报错.mp4<br />├──08新冠病毒数据分析<br />│ ├──30新冠病毒测序.mp4<br />│ ├──31下载新冠病毒基因组序列.mp4<br />│ ├──32下载新冠分析数据库.mp4<br />│ ├──33新冠病毒快速鉴定.mp4<br />│ ├──34新冠参考基因组拼接.mp4<br />│ ├──35新冠病毒拼接结果验证.mp4<br />│ ├──36拼接新冠病毒基因组.mp4<br />│ └──37ArticNetWork流程.mp4<br />├──09构建系统发育树<br />│ ├──38构建系统发育树.mp4<br />│ ├──39iTol美化系统发育树.mp4<br />│ └──40变种病毒识别.mp4<br />├──10二代基因组拼接<br />│ ├──41了解基因组拼接.mp4<br />│ ├──42基因组拼接原理.mp4<br />│ ├──43kmer估计基因组大小.mp4<br />│ ├──44二代测序拼接算法.mp4<br />│ └──45二代测序拼接实战.mp4<br />├──11拼接结果统计及评估<br />│ ├──46fasta格式文件介绍与处理.mp4<br />│ ├──47quast评估.mp4<br />│ ├──48busco评估.mp4<br />│ └──49tablet以及bandage评估.mp4<br />├──12基因组拼接探索<br />│ ├──50基因组拼接探索.mp4<br />│ └──51混合拼接.mp4<br />├──13三代测序基因组拼接<br />│ ├──52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4<br />│ ├──53组装结果纠错.mp4<br />│ ├──54细菌完成图.mp4<br />│ └──55不同物种拼接练习.mp4<br />├──14基因组序列分析<br />│ ├──56原核生物基因预测.mp4<br />│ ├──57真核生物基因预测.mp4<br />│ ├──58基因功能注释.mp4<br />│ ├──59ncRNA分析.mp4<br />│ └──60重复序列分析.mp4<br />├──15序列比对<br />│ ├──61blast比对.mp4<br />│ ├──62blast使用案例.mp4<br />│ └──63全局比对.mp4<br />├──16共线性分析<br />│ ├──64共线性分析.mp4<br />│ └──65MCScanX共线性分析.mp4<br />├──17基因家族分析<br />│ └──66基因家族分析.mp4<br />├──18测序数据比对<br />│ ├──67测序数据比对.mp4<br />│ ├──68段序列比对练习.mp4<br />│ ├──69长读长序列比对.mp4<br />│ └──70多重比对问题如何处理.mp4<br />├──19sam和bam文件处理<br />│ ├──71sam和bam格式文件介绍.mp4<br />│ ├──72sam和bam处理案例（上）.mp4<br />│ └──73sam和bam处理案例（下）.mp4<br />├──20Linux高级操作<br />│ ├──74生物信息常用文件格式.mp4<br />│ ├──75正则表达式.mp4<br />│ ├──76文件搜索.mp4<br />│ ├──77文本筛选grep.mp4<br />│ └──78文本编辑.mp4<br />├──21表格处理<br />│ ├──79cut-sort-uniq.mp4<br />│ ├──80表格处理awk.mp4<br />│ ├──81bioawk.mp4<br />│ ├──82csvtk.mp4<br />│ └──83datamash.mp4<br />├──22shell编程<br />│ ├──84shell变量.mp4<br />│ ├──85shell循环.mp4<br />│ └──86shell判断.mp4<br />├──23生物信息分析服务器简介<br />│ ├──87服务器简介.mp4<br />│ ├──88硬件选购.mp4<br />│ ├──89安装操作系统.mp4<br />│ ├──90选择RAID.mp4<br />│ ├──91设置云服务器.mp4<br />│ ├──92yum工具.mp4<br />│ └──93磁盘操作.mp4<br />├──24生物信息分析平台搭建<br />│ ├──100配置R语言分析环境.mp4<br />│ ├──101安装网络应用.mp4<br />│ ├──94基础环境配置.mp4<br />│ ├──95升级centos-stream.mp4<br />│ ├──96重置服务器练习.mp4<br />│ ├──97用户管理.mp4<br />│ ├──98配置生物软件.mp4<br />│ └──99配置生物数据库.mp4<br />├──25ubuntu系统配置<br />│ ├──102ubuntu系统配置.mp4<br />│ └──103虚拟机安装ubuntu.mp4<br />├──26R语言基础入门<br />│ ├──104R语言简介.mp4<br />│ ├──105R语言以及Rstudio安装.mp4<br />│ ├──106rstudio设置.mp4<br />│ ├──107开始使用R.mp4<br />│ ├──108R环境设置.mp4<br />│ ├──109R包管理.mp4<br />│ └──110文件操作.mp4<br />├──27R数据结构<br />│ ├──111向量.mp4<br />│ ├──112向量索引.mp4<br />│ ├──113矩阵.mp4<br />│ ├──114数据框.mp4<br />│ └──115因子列表缺失数据.mp4<br />├──28R数据处理<br />│ ├──116数据处理.mp4<br />│ ├──117数据转换.mp4<br />│ ├──118随机抽样以及数据探索.mp4<br />│ ├──119分组计算以及数据透视表.mp4<br />│ ├──120tidyverse.mp4<br />│ └──121dplyr数据处理.mp4<br />├──29R统计检验<br />│ ├──122独立性卡方检验.mp4<br />│ ├──123独立性t检验.mp4<br />│ └──124相关性检验.mp4<br />├──30R统计建模<br />│ ├──125统计建模.mp4<br />│ ├──126购物篮分析.mp4<br />│ └──127机器学习预测乳腺癌.mp4<br />├──31R基础绘图<br />│ ├──128R语言技巧.mp4<br />│ ├──129R基础绘图.mp4<br />│ ├──130直方图.mp4<br />│ ├──131饼图以及扇形图.mp4<br />│ ├──132条形图以及分组条形图.mp4<br />│ ├──133箱线图以及小提琴图.mp4<br />│ ├──134韦恩图.mp4<br />│ └──135绘图布局.mp4<br />├──32ggplot2绘图<br />│ ├──136ggplot2绘图.mp4<br />│ ├──137ggplot2散点图直方图条形图.mp4<br />│ ├──138ggplot2分组条形图以及箱线图.mp4<br />│ ├──139ggplot2小提琴图以及主题设置.mp4<br />│ ├──140ggplot2扩展.mp4<br />│ └──141科学文献绘图.mp4<br />├──33基因表达调控简介<br />│ ├──142基因表达调控.mp4<br />│ ├──143GEO数据库简介.mp4<br />│ └──144关于基因的概念.mp4<br />├──34RNAseq概述<br />│ ├──145RNAseq简介.mp4<br />│ ├──146RNAseq原理.mp4<br />│ ├──147RNAseq建库方法.mp4<br />│ ├──148RNAseq不同测序平台比较.mp4<br />│ └──149RNAseq定量方法.mp4<br />├──35RNAseq分析<br />│ ├──150RNAseq分析环境搭建.mp4<br />│ ├──151Bioconductor.mp4<br />│ ├──152下载参考序列.mp4<br />│ ├──153下载练习数据.mp4<br />│ ├──154数据质控过滤.mp4<br />│ ├──155hisat2建立索引.mp4<br />│ ├──156hisat2比对.mp4<br />│ ├──157featureCounts计数.mp4<br />│ ├──158STAR比对.mp4<br />│ └──159HTSeq-count计数.mp4<br />├──36利用R分析RNAseq数据<br />│ ├──160DESeq2分析RNAseq数据.mp4<br />│ ├──161DESeq2练习.mp4<br />│ ├──162edgeR分析RNAseq数据.mp4<br />│ └──163edgeR练习.mp4<br />├──37差异表达基因注释以及富集分析<br />│ ├──164差异表达基因功能注释.mp4<br />│ ├──165富集分析.mp4<br />│ ├──166注释富集练习.mp4<br />│ ├──167非模式生物注释富集.mp4<br />│ └──168GSEA分析.mp4<br />├──38单细胞测序概述<br />│ ├──169单细胞测序概述.mp4<br />│ ├──170单细胞测序原理.mp4<br />│ └──171_10xgenomics资源以及常见问题.mp4<br />├──39单细胞测序数据分析<br />│ ├──172单细胞分析环境搭建.mp4<br />│ ├──173利用cellranger分析单细胞数据.mp4<br />│ ├──174结果解读.mp4<br />│ ├──175LoupeBrowser.mp4<br />│ └──176_10x练习数据.mp4<br />├──40利用Seurat分析单细胞数据<br />│ ├──177安装Seurat.mp4<br />│ ├──178Seurat读取数据.mp4<br />│ ├──179质控过滤以及标准化.mp4<br />│ ├──180聚类.mp4<br />│ ├──181细胞亚群分类.mp4<br />│ ├──182寻找marker基因以及细胞鉴定.mp4<br />│ └──183Seurat练习.mp4<br />├──43空间转录组<br />│ └──192空间转录组.mp4<br />├──44宏基因组简介<br />│ ├──193宏基因组简介.mp4<br />│ └──194宏基因组建库测序.mp4<br />├──45宏基因组分析环境搭建<br />│ ├──195宏基因组分析环境搭建.mp4<br />│ └──196国内镜像下载宏基因组数据库.mp4<br />├──46三代nanopore测</pre>
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